Cпециалисты «Радона» (руководитель проекта С.А. Дмитриев) приступили к строительству новой плазменной установки сжигания отходов «Плутон», при помощи которой можно перерабатывать как жидкие, так и твердые отходы без тщательной сортировки. При этом образовавшийся конечный продукт (шлаковый компаунд) был чрезвычайно устойчив к агрессивным воздействиям и прочно фиксировал радиоактивные и другие опасные вещества. Этим достижением «Радона» сразу же заинтересовались ряд отечественных и иностранных организаций. Израильскую компанию «Энвайрментл энерджи» привлекла возможность установки перерабатывать как радиоактивные, так и другие типы отходов – бытовые, медицинские, химические.

В 2001 году прошла презентация Учебного Центра МосНПО «Радон», созданного под эгидой МАГАТЭ.

В 2001 году сотрудники МосНПО «Радон» отпраздновали 40-летний юбилей родного предприятия.

Были разработаны две новые установки: опытно-промышленная установка по пропитке твердых РАО высокопроникающими цементными растворами и миниблочная опытно-промышленная установка цементирования. Первый метод существенно помог в решении проблемы отверждения зольного остатка от сжигания горючих отходов. При помощи второго – не только осуществлялось цементирование отходов в контейнерах, но и была усилена герметичность старых хранилищ РАО.

В 2002 году деятельность МосНПО «Радон» по обеспечению радиационной безопасности Центрального региона России заслужила высокую государственную оценку. Группа сотрудников предприятия была награждена Премией Правительства РФ. Медали и удостоверения лауреатов получили генеральный директор И.А. Соболев, первый заместитель генерального директора С.А. Дмитриев, главный инженер А.С. Баринов, директор ОЗПРТ Ф.А. Лифанов, заместитель директора ОЗПРТ Н.В. Витик, главный технолог ОЗПРТ В.Н. Попков.

За многолетний самоотверженный труд в области обеспечения радиоэкологической безопасности были награждены Медалями Ордена «За заслуги перед Отечеством II степени А.П. Кобелев, В.И. Пантелеев, А.И. Дмитриев и Б.Н. Полухин.

Первому заместителю генерального директора МосНПО «Радон» Сергею Александровичу Дмитриеву за непосредственное участие в разработке технологий и методов локализации РАО было присвоено звание «Заслуженного деятеля науки Российской Федерации».

За ликвидацию опасной радиоэкологической ситуации в Абхазии были награждены Грамотами Правительства Москвы А.С. Волков и В.П. Летемин.

В этом же году МосНПО «Радон» был вручен диплом «Московское качество» за высокий уровень качества услуг по обращению с РАО.

В 2003 году в «Радоне» начались испытания новых хранилищ-скважин для радиоактивных отходов.

В 2003 году по рекомендации МАГАТЭ с помощью установки «Москит-1А» были проведены работы по кондиционированию отработавших источников ионизирующего излучения в хранилищах предприятия «ЭКОРЭС» в Белоруссии.
ГУП МосНПО «Радон» совместно с организациями США и «Курчатовским институтом» осуществил работу по усовершенствованию системы физической защиты предприятия, разработали дополнительные мероприятия по совершенствованию системы безопасности хранения радиоактивных материалов.

В областном Московском конкурсе молодых специалистов «Инженер ХХI века» приняли участие шесть сотрудников «Радона». Работа С.В. Карлина заняла на конкурсе третье место.
В 2004 году предприятие возглавил Сергей Александрович Дмитриев. Преемственность в развитии сохранилась.

На площадке НПК «Радон» началось строительство современного хранилища типа наземного монолитного железобетонного сооружения (здание №103). Проект был подготовлен в рамках программы ТАСИС специалистами Бельгии, Великобритании и Франции. Хранилище соответствует всем нормам и требованиям Евросообщества и МАГАТЭ по обеспечению радиационной безопасности при хранении РАО.

В 2005 году Правительство Москвы на базе МосНПО «Радон» организовало региональный информационно-аналитический центр учета и контроля радиоактивных веществ и радиоактивных отходов для реализации на территории города исполнительных функций соответствующей государственной системы.

В мае 2005 года специалисты МосНПО «Радон» приняли участие в международном форуме «Доркомэкспо-2005». Экспозицию предприятия посетили вице-мэр Москвы Валерий Шанцев и руководитель департамента ЖКХ Правительства Москвы Николай Павлов.

В ноябре на промплощадке «Радона» была проведена конференция Ядерного Общества России «Радиационная безопасность крупных городов и проблемы Ядерной энергетики» (незадолго до конференции генеральный директор МосНПО «Радон» С.А. Дмитриев был избран вице-президентом ЯОР).

В поселке Новый было построено и сдано в эксплуатацию современное здание для дежурных бригад «Скорой помощи» с гаражом на три автомобиля. Была открыта детская поликлиника.

Дозконтроль спецтранспорта	Лауреаты премии Правительства РФ	Начало строительства нового хранилища
С.А.Дмитриев со специалистами из США в производственном цехе	С.А.Дмитриев с вице-мэром Москвы В.П.Шанцевым на выставке «Доркомэкспо 2005»